[所屬分類(lèi):行業(yè)動(dòng)態(tài)] [發(fā)布時(shí)間:2025-4-27] [發(fā)布人:楊曉燕] [閱讀次數(shù):] [返回]

病原新型智能分型技術(shù)研究獲新進(jìn)展
作者：朱漢斌      來(lái)源：中國(guó)科學(xué)報(bào)
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近日，華南農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院教授廖明/張建民團(tuán)隊(duì)創(chuàng)新性地建立了一種可實(shí)現(xiàn)單核苷酸多態(tài)性多重精準(zhǔn)檢測(cè)的新型核酸等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)（ssLAMP），通過(guò)獨(dú)特的引物設(shè)計(jì)策略提高單核苷酸多態(tài)性檢測(cè)的靈活性和多引物體系的兼容性，結(jié)合便攜式檢測(cè)設(shè)備和結(jié)果智能分析手機(jī)APP，可實(shí)現(xiàn)對(duì)病原單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)的五重精準(zhǔn)現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)。相關(guān)成果在線發(fā)表于《先進(jìn)科學(xué)》（Advanced Science）。
單核苷酸多態(tài)性與傳染病或遺傳病等多種疾病風(fēng)險(xiǎn)密切相關(guān)，因此被視為分子診斷的關(guān)鍵生物標(biāo)志物。尤其對(duì)于高突變率病原體而言，病原微生物的感染性、傳播力及抗原性等都與單核苷酸多態(tài)性特征相關(guān)，在病原體鑒別診斷中具有重要價(jià)值。
傳統(tǒng)的單核苷酸多態(tài)性檢測(cè)技術(shù)如基因測(cè)序等依賴(lài)實(shí)驗(yàn)室精密儀器、耗時(shí)長(zhǎng)，無(wú)法滿(mǎn)足疫病爆發(fā)時(shí)對(duì)病原體的快速、現(xiàn)場(chǎng)、精準(zhǔn)檢測(cè)的需求。盡管當(dāng)前有部分基于LAMP的POCT檢測(cè)技術(shù)被建立用于單核苷酸多態(tài)性的快速檢測(cè)，但這些方法大多用于單一目標(biāo)靶點(diǎn)的檢測(cè)，多重突變檢測(cè)因LAMP復(fù)雜的引物集而難以實(shí)現(xiàn)。因此，開(kāi)發(fā)一種可靈活結(jié)合單核苷酸多態(tài)性特異性探針進(jìn)行多重突變檢測(cè)的新型等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)具有重要的研究意義和應(yīng)用價(jià)值。
研究團(tuán)隊(duì)在國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃等項(xiàng)目的資助下，通過(guò)創(chuàng)新引物設(shè)計(jì)思路，研究并建立了一種可實(shí)現(xiàn)單核苷酸多態(tài)性多重精準(zhǔn)檢測(cè)的ssLAMP。與傳統(tǒng)LAMP方法不同，ssLAMP方法將引物組內(nèi)一條環(huán)引物改造為線性引物，因此提供了更多的可放置單核苷酸多態(tài)性檢測(cè)探針的區(qū)域。這種簡(jiǎn)化的引物組合也減少了引物組的復(fù)雜程度，使得多重檢測(cè)的引物體系更容易實(shí)現(xiàn)，同時(shí)可以展現(xiàn)出與傳統(tǒng)LAMP方法媲美的擴(kuò)增效率和檢測(cè)靈敏度。
以新冠病毒S基因中不同的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)作為檢測(cè)靶標(biāo)時(shí)，利用Rnase H2酶水解DNA-RNA復(fù)合體的特性，設(shè)計(jì)可識(shí)別對(duì)應(yīng)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)信息的檢測(cè)探針，可以實(shí)現(xiàn)對(duì)新冠病毒奧密克戎變異株BA.1、BA.2、BA.3、BA.4和BA.5分支精準(zhǔn)識(shí)別。
進(jìn)一步，為了實(shí)現(xiàn)ssLAMP對(duì)病原的現(xiàn)場(chǎng)化、智能化多重檢測(cè)，研究人員研發(fā)了擁有恒溫加熱功能的FAM，SF670雙熒光通道便攜式檢測(cè)設(shè)備，同時(shí)配套對(duì)應(yīng)的結(jié)果智能分析手機(jī)APP，通過(guò)對(duì)不同反應(yīng)管中不同熒光信號(hào)的HSV色域進(jìn)行分析，可在1小時(shí)內(nèi)實(shí)現(xiàn)對(duì)BA.1-BA.5不同變異株的精準(zhǔn)智能多重檢測(cè)。
該研究建立了一種引物設(shè)計(jì)靈活性強(qiáng)，可對(duì)多個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)進(jìn)行多重精準(zhǔn)檢測(cè)的新型核酸等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)。結(jié)合便攜式檢測(cè)設(shè)備以及智能手機(jī)APP，可實(shí)現(xiàn)病原的現(xiàn)場(chǎng)化、精準(zhǔn)化、智能化快速檢測(cè)和基因分型，在動(dòng)物疫病精準(zhǔn)防控、病原基因分型等領(lǐng)域有重要的應(yīng)用價(jià)值。
相關(guān)論文信息：https://doi.org/10.1002/advs.202502708
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